О проекте
Научный руководитель проекта
Муслимова Жадыра Умирбеккызы
PhD докторант
Scopus Author ID: 58820604900
ORCID: https://orcid.org/0000-0003-3485-7240/print
Актуальность
Проект имеет научную новизну, так как впервые в Республике Казахстан на большой выборке планируется проводить генотипирование образцов ДНК коров молочных пород по локусам генов: L-селектин, MX1, TLR4, CXCR1, BRCA1, CD14, ATP1A1, будут определены такие критерий, как частота аллелей и генетических вариантов, уровень гомозиготности и гетерозиготности популяции, значение критерия χ2, генное равновесие, выявление животных, с низким содержанием соматических клеток в молоке, отбор животных с комплексным желательным генотипом, выбор SNP полиморфизмов, достоверно оказывающих влияние на заболеваемость субклиническим маститом в качестве ДНК маркера, будет разработан Реал Тайм ПЦР способ генотипирования по локусам генов MX1, CD14, ATP1A1.
Цель
Исследование SNP полиморфизмов у коров голштинской и джерсейской пород, ассоцированных с резистентностью к маститам и с содержанием соматических клеток в молоке, оптимизация методики генотипирования по локусам генов L-селектин, MX1, TLR4, CXCR1, BRCA1, CD14, ATP1A1, разработка Реал Тайм ПЦР способа генотипирования, селекция коров с генотипом, устойчивых к заболеваниям молочной железы.
Ожидаемые и/или достигнутые результаты
По результатам научного проекта исполнителями проекта будут опубликованы: - не менее 2 (двух) статей в журналах из первых трех квартилей по импакт-фактору в базе данных Web of Science или имеющих процентиль по CiteScore в базе данных Scopus не менее 50. Согласно заявленной тематике будут генотипированы 200 коров голштинской породы, 200 коров джерсейской породы по следующим локусам генов: локусам L-селектин, MX1, TLR4, CXCR1, BRCA1, CD14, ATP1A1, аллели которых оказывают ассоциативное влияние на заболеваемость маститом и на содержание соматических клеток в молоке. В теоретическом аспекте будут получены интересные на наш взгляд результаты: распространенность генетических вариантов, частота аллелей, генное равновесие, значение критерия χ2, генное равновесие по изучаемым локусам генов у исследуемых животных. Исследование носит приладной харакетер, в результате генотипирования будут определены животные с желательным генотипом, более воспримчивые к патологиям молочной железы, с низким содержанием соматических клеток в молоке, будут определены особи с комплексным желательным генотипом, которые более учтойчивы к маститам. По результатам исследования будут определены, гены, аллели которых достоверно связаны с содержанием соматических клеток в молоке, выявленные SNP полиморфизмы будут рекомендованы в качестве ДНК маркеров резистентности к маститам у молочных коров, будут включены эти ДНК маркеры в селекционные программы молочного скота в Республике Казахстан. Генотипирование коров по локусам генов локусам L-селектин, MX1, TLR4, CXCR1, BRCA1 будет проводиться с помощью сущетсвующих ПЦР ПДРФ метода, для генотипирования образцов ДНК по локусу гена ATP1A1 поиск необходимой рестриктазы будет осуществлен с помощью прогаммы NEBcutter (https://nc3.neb.com/NEBcutter/prj/p0JkXBs6219-PGDSj_Unnamed ) и для генотипирования коров по локусам генов MX1, CD14, ATP1A1 будет разработан Реал Тайм ПЦР способ, который сокращает длительность молекулярно-генетического анализа образцов. На основании полученных результатов будут оформлены две заявки для получения инновационного патента на изобретение РК. Проект имеет социально-экономический эффект, так как обеспечение населения мегаполима города Алматы экологически чистой продукцией является государственной задачей агропромышленного сектора экономики, внедрение результатов исследования позволяет снизить заболеваемость молочного скота маститом, будут отобраны животные с копмлексным желательным генотипом. Ранее нами было направлено предложение в МСХ РК по созданию Республиканского центра по генетическому мониторингу племенных животных на носительство таких скрытых генетических дефектов, как гаплотипы фертильности HH1, HH2, HH3, HH4, HH5, HH6, HCD, BC, BLAD, CVM, DUMPS, FXID, JH1, JH5, синдрома субфертильности у быков производителей, на основании полученных результатов будем рекомендовать отдельные SNP полиморфизмы в качестве ДНК маркеров резистентности к маститам. Результаты исследования будут внедрены в учебный процесс по элективной дисциплине «Молекулярно-генетические методы диагностики в ветеринарии» для студентов образовательной программы «Ветеринарая медицина».
Информация для потенциальных пользователей
Анализ отечественной литературы показывает, что имеются публикации Казахстанских ученых по изучению ассоциативного влияния аллелей генов ассоцированных с содержанием соматических клеток и заболеваемостью с маститами. Считаем, что изучение SNP полиморфизмов связанных с содержанием соматических клеток в молоке, выявление коров устойчивых к маститам, разработка молекулярно-генетических методов генотипирования коров по локусам генов L-селектин, MX1, TLR4, CXCR1, BRCA1, CD14, ATP1A1 являются актуальной проблемой ветеринарной науки, определение количества соматических клеток и остаточного количества антибиотиков в молоке имеет большое практическое значение В нашей стране впервые на большой выборке планируется проводить генотипирование образцов ДНК коров молочных пород по семи локусам генов, будут определены такие критерий, как частота аллелей и генетических вариантов, уровень гомозиготности и гетерозиготности популяции, значение критерия χ2, генное равновесие, выявление животных, с низким содержанием соматических клеток в молоке, отбор животных с комплексным желательным генотипом, выбор SNP полиморфизмов, достоверно оказывающих влияние на заболеваемость субклиническим маститом в качестве ДНК маркера, будет разработан Реал Тайм ПЦР способ тестирования по локусам генов MX1, CD14, ATP1A1.
Члены исследовательской группы
Усенбеков Есенгали Серикович (научный консультант)
usen03@mail.ru
кандидат биологических наук, профессор
Scopus Author ID: 56465995700
Researcher ID: rid93491
ORCID: https://orcid.org/0000-0001-9508-4179